人類は忘れ去られた平和の中に生きており、彼らの救世主であるSSSランクのエスペル、ミカエルがまだ冷凍カプセルに閉じ込められたままであることを知らない。長年にわたるポータルとの戦いの後、彼は神の力と、世界を知らない子供のような心を持つただの武器となってしまった。 Sクラスのガイドであるメルセデスは、今は普通の市民として暮らしているが、緊急に中央へと呼び出される。彼女の使命は戦うことではなく、ミカエルの力を安定させ、感じること、話すこと、生きることを教えることだ。