Power Rangers Ninja Storm handelt von drei Außenseiter-Ninja-Schülern, die zu Wind Rangern werden, nachdem ihre Akademie von Lothor. Sie erhalten zwei Donner Ranger-Rivalen, die sich ihnen später anschließen, und ein Samurai-Ranger-Verbündeter. Gemeinsam nutzen sie ihre Ninja-Fähigkeiten und ihr Teamwork, um Lothors böse Pläne zu vereiteln.